De origen visigodo, el cenobio fue arrasado por los árabes y reconstruido por Santo Domingo, cuyos restos se conservan en un sepulcro excavado en la roca. Regentado por monjes benedictinos que celebran misas gregorianas.

Su claustro románico, cuyo piso bajo es el más importante, data de los siglos XI y XII, y posee hermosos arcos de medio punto sobre capiteles esculpidos con temas muy variados que, a su vez, descansan sobre dobles columnas. En el claustro inferior se perciben claramente dos fases de ejecución: durante la primera se llevaron a cabo las galerías norte y este; la segunda se desarrolló en el siguiente siglo y en ella se ejecutaron las galerías sur y oeste.

Lo más destacable es la colección de los 64 capiteles de que consta el claustro bajo y los relieves que ornamentan las caras interiores de las cuatro pilastras que forman los ángulos de la galería. Al primer maestro serían asignables seis de los relieves con las siguientes escenas: La ascensión y Pentecostés. El sepulcro y el descendimiento. Los discípulos de Emaús y la duda de Santo Tomás. El segundo maestro sería el autor de los dos relieves restantes: La anunciación a María y el árbol de Jessé. Los capiteles, y en especial los del segundo artista, son obras maestras de la iconografía románica y lo más admirado y llamativo de todo el claustro.

En el siglo XVIII, la iglesia románica fue destruida y reconstruida por el arquitecto Ventura Rodríguez en estilo neoclásico. Cuenta también con una excelente biblioteca y una botica del siglo XVIII, que reúne una colección de tarros de Talavera y un laboratorio farmacéutico.