Se inaugura en 1958 con los fondos procedentes del Museo Municipal (Sección de Arqueología y Antropología), de la Comisaría Provincial de Excavaciones Arqueológicas del “Gabinete Científico”; además de las adquisiciones de pequeñas colecciones como las del extinguido Museo Villa Benítez, Vallabriga y Casa Ossuna y donaciones particulares.

En la década de los años 60-70 se van incrementando los fondos con materiales de otras procedencias geográficas: Sahara, Etnografía Africana y Arqueología Precolombina.

En los años 80 se produce se cambia la dirección del Museo y con él una profunda remodelación. Se incrementa el personal científico y aumentan los fondos arqueológicos gracias a las colecciones de Mazuelas, Massanet, Santigao Melián, Santiago de la Rosa y Hermógenes Afonso (Hupalupa).

En 1990 se crea el O.A.M.C. (Organismo Autónomo de Museos y Centros) que depende del Cabildo de Tenerife, dónde el Museo queda integrado en el Museo de La Naturaleza y el Hombre.

El Museo de la Naturaleza y el Hombre presenta, a través de un proyecto expositivo de moderna museografía, la labor de investigación y conservación desempeñada durante décadas por los Museos de Ciencias Naturales y Arqueológico de Tenerife. En resultado permite, por un lado conocer la riqueza natural de las Islas Canarias y, por otro descubrir la mayor colección existente sobre la cultura guanche, pueblo aborigen que habitaba la isla de Tenerife antes de la llegada de los primeros conquistadores europeos.

El gran objetivo del Museo de la Ciencia y el Cosmos es despertar y desarrollar la curiosidad por el mundo de la Ciencia y el Universo, siendo un vehículo cultural abierto a todo tipo de demandas e inquietudes. Desde su inauguración en 1993 y con el respaldo del Instituto de Astrofísica de Canarias, este museo exhibe un centenar de módulos y experimentos interactivos que permiten acercar ideas científicas al conjunto de la sociedad. Exposiciones temporales, sesiones de planetario, charlas de divulgación, talleres didácticos, proyección y debate de películas de contenido científico, acampadas y noches astronómicas entre otras actividades que complementan su oferta expositiva.

El museo se sitúa en el centro de la ciudad en el antiguo Hospital Civil, ejemplo de arquitectura neoclásica canaria declarado Bien de Interés Cultural con la categoría de Monumento en 1983.